Οι υποδομές στο 4ο Λύκειο Αμαρουσίου-Ζεκάκειο είναι κατάλληλες για μαθητές, εκπαιδευτικούς και γονείς/κηδεμόνες με κινητικά προβλήματα. Ειδικότερα, η είσοδος στο χώρο του προαυλίου γίνεται απρόσκοπτα από το πεζοδρόμιο της οδού Ζεκάκου. Υπάρχουν ράμπες με μικρή κλίση, ώστε η πρόσβαση στο εσωτερικό του κτιρίου αλλά και στον προαύλιο χώρο να συντελείται απρόσκοπτα, ενώ το σχολείο διαθέτει ανελκυστήρα για τη μετακίνηση μεταξύ των  ορόφων. Να επισημανθεί, τέλος, ότι υφίσταται τουαλέτα ειδικά κατασκευασμένη για εμποδιζόμενα άτομα.