Το Νηπιαγωγείο Αφρατίου συστεγάζεται με το Δημοτικό Σχολείο Αφρατίου.
Τη σχολική χρονιά 2024 – 2025 λειτουργεί ως διθέσιο με δύο υποχρεωτικά πρωινά τμήματα και ένα προαιρετικό ολοήμερο
Τη σχολική χρονιά 2023 – 2024 λειτουργεί ως διθέσιο με δύο υποχρεωτικά πρωινά τμήματα και ένα προαιρετικό ολοήμερο τμήμα.
Τη σχολική χρονιά 2022- 2023 λειτούργησε ως διθέσιο.
Υποβιβάστηκε σε μονοθέσιο με το ΦΕΚ 4582/Β/30-08-2022.
Τη σχολική χρονιά 2021 – 2022 το Νηπιαγωγείο Αφρατίου λειτούργησε ως μονοθέσιο
το 2010 ορίστηκε με απόφαση του υπουργείου πιλοτικό για τα νέα αναλυτικά προγράμματα.
το 2009 πήρε και εκτέλεσε με επιτυχία το πρόγραμμα αυτοαξιολόγησης της σχολικής μονάδας,
το 2006 συμμετείχαμε στο πρόγραμμα “Ομαλή μετάβαση των νηπίων από το Νηπιαγωγείο στο Δημοτικό Σχολείο”.