Στις 23 Αυγούστου 1986 ιδρύεται με το Προεδρικό Διάταγμα 313 (ΦΕΚ 137/1986 τ. Α΄) το Γυμνάσιο Κιμώλου.

Κατά το σχολικό έτος 1986-1987 πραγματοποιείται η επίσημη λειτουργία του Γυμνασίου Κιμώλου, ως σχολικής μονάδας παροχής τυπικής δευτεροβάθμιας εκπαίδευσης στο νησί της Κιμώλου.

Έκτοτε, σύμφωνα με τις διατάξεις της παρ. 1 του άρθρου 5 του Ν.1566/85, σκοπός του Γυμνασίου Κιμώλου είναι η προώθηση, εντός του πνεύματος του ευρύτερου σκοπού της εκπαίδευσης, της ολόπλευρης ανάπτυξης των μαθητών σε σχέση με τις δυνατότητες που έχουν στην ηλικία αυτή και τις αντίστοιχες απαιτήσεις της ζωής. Σύμφωνα με τις διατάξεις της παρ.2 του άρθρου 6 του αυτού νόμου, σκοπός των Λυκείου είναι η επιδίωξη της ολοκλήρωσης των σκοπών της εκπαίδευσης.