Άρθρα με καρτέλα "βακτήρια"

LUCA, η πρώτη μορφή ζωής;

Μην περιμένεις καμιά ηχηρή ανακάλυψη απολιθώματος! Ο πρόγονος (progenote) όλων των εμβίων προσεγγίστηκε in silico μόνο, δηλ. με τη βοήθεια αλγορίθμων ειδικευμένων στην ανάλυση γονιδιωματικών αλληλουχιών, και το γενετικό πορτρέτο του βάσει τέτοιων αναλύσεων πρόσφερε τις πρώτες νύξεις σχετικά με την οικολογία του, το φυσικό περιβάλλον όπου πιθανότατα ζούσε. Μα πού βρισκόμαστε; Μεταφερθείτε νοερά στο παρελθόν της Γης, κάπου  4 δισεκατομμύρια χρόνια πίσω … λίγο φως στο μυστήριο του πώς πρωτοαναδύθηκε η ζωή στη Γη!

Ας δούμε πώς παρουσιάστηκαν (εδώ) τα ευρήματα αυτά από τον Nicholas Wade στην εφημερίδα New York Times πριν από 3 μέρες:

Αυτός ο σεβάσμιος πρόγονος ήταν μονοκύτταρος, ίσως κάτι σαν τα γνωστά μας βακτήρια· τον βάφτισαν με μεγάλο όνομα, ή τουλάχιστον το ακρωνύμιό του: είναι γνωστός ως Last Universal Common Ancestor (LUCA, ο έσχατος παγκόσμιος/καθολικός κοινός πρόγονος)· εκτιμάται ότι έζησε πριν από περίπου 4 δισεκατομμύρια χρόνια, όταν η ηλικία της Γης είχε φτάσει αισίως τα 560 εκατομμύρια χρόνια.

VentontheOceanFloor

Με το νέο αυτό εύρημα φαίνεται πως οξύνεται η διαμάχη μεταξύ όσων πιστεύουν ότι η ζωή ξεκίνησε σε κάποιο ακραίο περιβάλλον, όπως λόγου χάρη στα υδροθερμικά ανοίγματα της βαθιάς θάλασσας [ΥδΑΒθ] ή στις πλαγιές ενεργών ηφαιστείων, και εκείνων που είναι υπέρ της άποψης – μάλιστα την πρωτοπρότεινε ο Δαρβίνος – περί φυσιολογικότερου περιβάλλοντος, όπως μια «ζεστή λιμνούλα».

Σχετικά με τη φύση του πρώτου προγόνου όλων των εμβίων επικρατεί ασάφεια επί μακρόν, διότι απλούστατα οι τρεις μεγάλες βασικές υποδιαιρέσεις της ζωής (γνωστές ως επικράτειες), δηλ. τα βακτήρια, τα αρχαία (archaea) και οι ευκαρυώτες, δεν εμφανίζουν κάποια κοινή αφετηρία ως προς την προέλευσή τους.  Ας σημειωθεί ότι τα αρχαία μοιάζουν με τα βακτήρια, ενώ οι ευκαρυώτες περιλαμβάνουν όλα τα γνωστά φυτά και ζώα.

LucaTree

Οι ειδικοί της εξέλιξης έχουν πλέον καταλήξει να πιστεύουν  ότι τα βακτήρια και τα αρχαία αποτέλεσαν τις δύο πιο πρώιμες επικράτειες της ζωής, με την ανάδυση των ευκαρυωτικών οργανισμών να ακολουθεί αργότερα. Βασιζόμενη σε αυτή τη θεώρηση, ομάδα εξελικτικών βιολόγων στο Ντίσελντορφ της Γερμανίας, υπό την καθοδήγηση του William F. Martin, στο Πανεπιστήμιο Heinrich Heine, προσπάθησε να ρίξει φως στη φύση του οργανισμού από τον οποίο αναδύθηκαν τα αρχαία και τα βακτήρια (εδώ).   

Ξεκίνησαν από τα γνωστά γονίδια που κωδικοποιούν πρωτεΐνες στα αρχαία και τα βακτήρια.  Σκεφτείτε μόνο ότι κατά την τελευταία εικοσαετία έχουν συσσωρευτεί στις τράπεζες γενετικών δεδομένων κάπου 6 εκατομμύρια τέτοια γονίδια, αφού οι επιστήμονες με τις σύγχρονες μηχανές ταχείας αποκωδικοποίησης έχουν αποθέσει γονιδιακές αλληλουχίες από χιλιάδες μικροοργανισμούς.

Τα γονίδια που εξυπηρετούν την ίδια λειτουργία στον άνθρωπο και τον ποντικό εμφανίζουν μεταξύ τους συγγένεια λόγω της καταγωγής τους από κάποιο αρχέγονο γονίδιο το οποίο ανήκε στο πρώτο προγονικό θηλαστικό. Με βάση λοιπόν τη σύγκριση των αλληλουχιών τους σε επίπεδο DNA, τα γονίδια μπορούν να ταξινομηθούν σε εξελικτικά δένδρα οικογενειών, ιδιότητα που επέτρεψε στον Δρ Martin και τους συνεργάτες του να χωρίσουν τα 6 εκατομμύρια γονίδια σε ένα πολύ μικρό αριθμό γονιδιακών οικογενειών. Από αυτές τις οικογένειες, μόνο 355 ικανοποιούσαν τα κριτήριά τους ότι πιθανόν να προέρχονται από τον Luca, ως τον κοινό πρόγονο βακτηρίων και αρχαίων.

Είναι επίσης γνωστό ότι η λειτουργία των γονιδίων προσαρμόζεται στο περιβάλλον ενός οργανισμού. Ως εκ τούτου, ο Δρ Martin έλπιζε ότι με τον εντοπισμό των γονιδιακών αλληλουχιών που πιθανότατα υπήρχαν στον Luca, θα ήταν επίσης σε θέση να σχηματίσει άποψη για το πού και πώς διαβίωνε αυτή η μορφή ζωής. Ο ίδιος δήλωσε ότι «Το αποτέλεσμα με άφησε εμβρόντητο, δεν το πίστευα!»

Πράγματι, τα 355 γονίδια οδήγησαν με αρκετή ακρίβεια σε έναν οργανισμό ο οποίος πρέπει να ζούσε σε συνθήκες όπως αυτές που απαντούν στα ΥδΑΒθ.

 Τα ΥδΑΒθ φιλοξενούν εξωτικές μορφές ζωής και με τις ακραίες χημικές συνθήκες που ισχύουν εκεί ανέκαθεν θεωρούνταν καλές θέσεις για την πιθανή προέλευση της ζωής. Μεταξύ των 355 γονιδίων που αποδόθηκαν στο Luca περιλαμβάνονται ορισμένα που σχετίζονται με τον μεταβολισμό του υδρογόνου ως πηγή ενέργειας καθώς επίσης και ένα γονίδιο υπεύθυνο για το ένζυμο αντίστροφη γυράση· τα εν λόγω γονίδια απαντούν μόνο σε υπερθερμόφιλους μικροοργανισμούς [ικανούς να διαβιούν σε ακραία υψηλές τιμές θερμοκρασίας], όπως ανέφεραν ο Δρ Martin και οι συνεργάτες του την περασμένη Δευτέρα στο Nature Microbiology.

Με βάση το εύρημα αυτό «κατανοήσαμε σε σημαντικό βαθμό τον τρόπο ζωής του Luca», διαπιστώνει ο James O. McInerney από το Πανεπιστήμιο του Manchester σε σχόλιό του στο ίδιο επιστημονικό περιοδικό (εδώ), και φυσικά «σχηματίσαμε μια γενικότερη εικόνα για τη ζωή πριν από 4 δισεκατομμύρια χρόνια.» 

Το πορτρέτο του Luca σύμφωνα με τον Δρ Martin φαίνεται πως θα τύχει ευρείας αποδοχής· έχει όμως προχωρήσει και ένα βήμα παραπάνω ώστε να αποτελέσει αντικείμενο σημαντικής επιστημονικής διαμάχης. Ο Δρ Martin υποστηρίζει ότι ο Luca εντοπίζεται πολύ κοντά στην απαρχή της ίδιας της ζωής. Από τον εν λόγω οργανισμό ελλείπουν τόσα πολλά γονίδια αναγκαία για τη ζωή, που σημαίνει ότι πρέπει να εξαρτιόταν σε σημαντικό βαθμό από τα χημικά συστατικά του περιβάλλοντός του· ως εκ τούτου πρέπει να θεωρείται «ημι-ζωντανός», σημειώνει.

Η εξάρτηση του Luca από το υδρογόνο και διάφορα μέταλλα είναι υπέρ της θεώρησης ότι το περιβάλλον ενός ΥδΑΒθ ευνόησε την απαρχή της ζωής, συμπεραίνει ο Δρ Martin, εν αντιθέσει προς το χερσαίο περιβάλλον που προτείνεται στην αντίπαλη θεωρία του χημικού John Sutherland από το Πανεπιστήμιο του Cambridge στην Αγγλία.

Άλλοι πάλι πιστεύουν ότι ο Luca, όπως περιγράφηκε από τον Δρ Martin, αντιπροσώπευε ήδη έναν πολύ εκλεπτυσμένο εξελικτικά οργανισμό και μάλιστα απομακρυσμένο από την απαρχή της ζωής, την οποία θα συνιστούσαν έμβια συστήματα σχηματισμένα από τα χημικά υλικά της πρώιμης Γης.

Μεταξύ του Luca και του πρώιμου εκείνου συστήματος που μπορεί να θεωρηθεί η απαρχή της ζωής «μεσολαβεί πελώρια απόσταση από εξελικτικές καινοτομίες» δήλωσε ο Jack Szostak από το Γενικό Νοσοκομείο της Μασαχουσέτης, ο οποίος έχει μελετήσει τις πιθανές εξελικτικές διεργασίες των πρώτων κυτταρικών μεμβρανών.

Από τα δεδομένα του Δρ Martin είναι σαφές ότι ο Luca μάλλον κατάφερνε να επιτελεί τη σύνθετη διεργασία της πρωτεϊνοσύνθεσης. Και δείχνει απίθανο να μην μπορούσε επίσης να συνθέτει απλούστερα συστατικά, μολονότι τα αναγκαία γονίδια για κάτι τέτοιο δεν ανιχνεύτηκαν σε αυτόν, δήλωσε ο Steven A. Benner από το Ίδρυμα για την Εφαρμοσμένη Μοριακή Εξέλιξη. «Είναι σαν να δέχεσαι ότι είσαι ικανός να κατασκευάσεις ένα 747, ενώ συγχρόνως αδυνατείς να ραφινάρεις τον σίδηρο.»  

Επίσης ο Δρ Sutherland δεν πολυπίστεψε την θεώρηση ότι ο Luca ίσως τοποθετείται σε μια γκρίζα μεταβατική ζώνη μεταξύ ζωής και μη ζωής επειδή εξαρτιόταν από το περιβάλλον του σε ό,τι αφορά κάποια απαραίτητα συστατικά. «Είναι σαν να λες ότι είμαι και διατηρούμαι ημι-ζωντανός, διότι εξαρτώμαι από το σουπερμάρκετ της περιοχής μου.»

Ο Δρ Sutherland και άλλοι επιστήμονες σαφώς δεν έχουν θέμα να δεχτούν τη σύνδεση του Luca με τα ΥδΑΒθ, αλλά κάτι τέτοιο δεν σημαίνει ότι η ζωή προήλθε από εκεί, όπως ισχυρίζονται. Η απαρχή της ζωής θα μπορούσε να ξεκινήσει οπουδήποτε, και αργότερα να περιορίστηκε στο περιβάλλον της βαθιάς θάλασσας εξαιτίας κάποιας καταστροφής όπως ο Όψιμος Βαρύς Βομβαρδισμός, μια βροχή μετεωριτών η οποία χτύπησε τη Γη με τόση ενέργεια που έβρασε τους ωκεανούς σε μια πυρακτούμενη ομίχλη πριν από 4 έως 3,8 δισεκατομμύρια χρόνια.

Η πολυπλοκότητα της ζωής είναι τόση ώστε απαιτεί πολλά εκατομμύρια χρόνια εξέλιξης. Εντούτοις, τα στοιχεία για την πιο πρώιμη μορφή ζωής είναι ηλικίας 3,8 δισεκατομμυρίων ετών, σαν να αναδύθηκε σχεδόν στο λεπτό που έπαυσε εκείνος  ο Βομβαρδισμός. Η καταφυγή λοιπόν στα βάθη του ωκεανού κατά τη διάρκεια του Βομβαρδισμού θα έδινε στη ζωή το περιθώριο για εξελικτικές διεργασίες μεγαλύτερης διάρκειας. Οι χημικοί, όμως, όπως ο Δρ Sutherland λένε ότι δεν μένουν ήσυχοι με την ιδέα να εργάζεται η όποια προβιοτική χημεία σε συνθήκες ωκεανού, εντός του οποίου τα χημικά συστατικά όντας πολύ αραιωμένα δύσκολα θα κατάφερναν να συγκροτήσουν τα σύνθετα μόρια της ζωής.

Ο Δρ Sutherland βασιζόμενος στις κύριες αρχές της χημείας, έχει βρει ότι το ηλιακό υπεριώδες φως αποτελεί βασική πηγή ενέργειας για την πραγματοποίηση χημικών αντιδράσεων, και ως εκ τούτου θεωρεί τις λίμνες της ξηράς ως το ιδανικότερο περιβάλλον για την έναρξη της ζωής παρά τον ωκεανό. «Δεν ξεκινήσαμε με ένα σενάριο που προτιμούμε, αλλά συναγάγαμε ένα σενάριο βασιζόμενοι στη χημεία», δήλωσε εκφράζοντας συγχρόνως τα παράπονά του προς τον Δρ Martin επειδή δεν προχώρησε σε κάποιες χημικές προσομοιώσεις για να υποστηρίξει το σενάριο περί ΥδΑΒθ.

Το πορτρέτο του Luca σύμφωνα με τον Δρ Martin «έχει πολύ ενδιαφέρον, δεν έχει όμως καμία σχέση με την πραγματική προέλευση της ζωής», είπε ο Δρ Sutherland.

Επέλεξα σκόπιμα την παρουσίαση στους New York Times παρά την αντίστοιχη στο περιοδικό New Scientist (εδώ), αφού στην πρώτη διακρίνεται σαφέστερα και τεκμηριώνεται μια επιστημονική διαφωνία. Η μετάφραση-επιμέλεια του άρθρου είναι δική μου.

Ετικέτες: , , , , , , , , , , ,

Καθαρή & ασφαλής μαγιονέζα!

salmonella-bacteria

Σ Α Λ Μ Ο Ν Ε Λ Α

Πανταχού παρούσα

Μαθαίνουμε πώς θα προφυλαχθούμε από το πιο διαδεδομένο βακτήριο των τροφίμων.

 Τι συνδέει το ωμό κοτόπουλο, τα ωμά αβγά και το ωμό ψάρι; Και τα τρία απο­τελούν εύφορο έδαφος για την ανά­πτυξη σαλμονέλας, ενός βακτηρίου πολύ διαδεδομένου στο περιβάλλον. Η σαλμονέλα αποτελεί ένα από τα κύ­ρια αίτια των τροφικών δηλητηριάσεων και ζει στο έντερο ζωντανών οργανισμών, του ανθρώπου, των ζώων και των πτηνών, ακόμη και όταν πάψουν να ζουν – βλ. νωπό κρέας.

Η σαλμονέλωση, η λοίμωξη που προκαλεί το βακτή­ριο, οφείλεται στην κατανάλωση μη μαγειρεμένου ή ατελώς μαγειρεμένου κρέατος, μολυσμένου νερού ή μολυσμένης τροφής. Μπορεί αυτή να είναι κοτόπου­λο, απαστερίωτο γάλα, αβγά, μαλάκια και οστρακο­ειδή, αλλά και λαχανικά ή άλλα τρόφιμα που έχουν έρθει σε επαφή με το βακτήριο (μέσω περιττωμάτων από ζώα, από κακή συντήρηση ή από επαφή με υπο­λείμματα κρέατος, πουλερικού ή ψαριού).

Το βακτήριο μπορεί να εισαχθεί στον ανθρώπινο οργανισμό με την επαφή. Συχνά η μόλυνση οφεί­λεται σε χειριστές τροφίμων (σερβιτόρους, αλλαντοποιούς, μάγειρες), που δεν τηρούν τους κανό­νες υγιεινής και γίνονται ασυμπτωματικοί φορείς.

Πώς αναπτύσσεται

Η θερμοκρασία είναι βασική προϋπόθεση για την ανάπτυξη ή την καταστροφή της σαλμονέλας. Στο ψυγείο, σε θερμοκρασίες κάτω από 4°C το βακτήριο δεν αναπτύσσεται. Μόλις όμως η πρώτη ύλη εκτεθεί σε υψηλότερη θερμοκρασία, μπορεί να αναπτυχθεί, ενώ σε θερμοκρασίες πάνω από 70° πεθαίνει. Αν βρά­σουμε ένα μολυσμένο αυγό, η σαλμονέλα θα πάψει να υπάρχει. Αυτός είναι και ο λόγος που θεωρούμε ασφαλή τα τρόφιμα που έχουν ψηθεί καλά.

Διάγνωση, συμπτώματα, ίαση

Ο χρόνος επώασης του βακτηρίου είναι από 12 μέχρι και 36 ώρες αφού εισέλθει στον οργανισμό. Τα συμπτώματα είναι συνήθως διάρροια, πυρετός και κοιλόπονος. Διαρκούν από 4 έως 7 ημέρες, μπορεί να είναι ήπια (μόνο διάρροια) ή και πιο έντονα, με πολυήμερο πυρετό, κοιλιακό άλγος και αφυδάτωση. Η διάγνωση γίνεται με κλινική εξέταση σε πρώτη φάση και στη συνέχεια με μικροβιολογικό έλεγχο. Ωστόσο η σαλμονέλωση είναι νόσος αυτοϊώμενη – δηλαδή θεραπεύεται μόνη της. Για να ανακουφιστούμε, αντιμετωπίζουμε τα συμπτώματα με φαρμακευτική αγωγή: αντιπυρετικά, πολλά υγρά για την αφυδάτωση, παυσίπονα. Κάποιες φορές, και αν τα συμπτώματα επιμένουν, μπορεί να χρειαστεί χορήγηση αντιβίω­σης. Περισσότερη προσοχή δίνουμε σε συγκεκριμέ­νες ομάδες ανθρώπων, όπως είναι τα μικρά παιδιά, οι ηλικιωμένοι, όσοι βρίσκονται σε ανοσοκαταστολή και οι εγκυμονούσες.

Προσοχή στα ωμά αυγά

Αν θέλουμε να φτιάξουμε μαγιονέζα ή άλλες παρα­σκευές με ωμά αυγά, καλό είναι να γνωρίζουμε τα εξής:

  • Τα βιομηχανοποιημένα αυγά είναι πιο ασφαλή από τα «φρέσκα» που μπορεί να μας φέρει πεσκέσι ένας φίλος από την επαρχία. Τα πρώτα είναι καθαρισμένα από κόπρανα πουλερικών, έχουν ελεγχθεί με υπε­ριώδεις ακτίνες για την αρτιότητά τους και φέρουν ημερομηνία παραγωγής.
  • Αποφεύγουμε την κατανάλωση ωμών αυγών αν δεν είμαστε σίγουροι για τη φρεσκάδα τους – όσο πιο φρέσκα, τόσο μικρότερος ο κίνδυνος να είναι μολυσμένα, αφού το βακτηρίδιο δεν προλαβαίνει να αναπτυχθεί.
  • Φτιάχνουμε τις παρασκευές μας με ελεγμένα αυγά και τις βάζουμε αμέσως στο ψυγείο. Τις καταναλώ­νουμε αμέσως.

Μια εύκολη συνταγή για μαγιονέζα μπορείτε να βρείτε στην ακόλουθη εικόνα:

Ενώ αξίζει να διαβάσετε κάποια προφυλακτικά μέτρα κουζινικής συμπεριφοράς για να κρατήσουμε τη σαλμονέλα έξω από τα τρόφιμά μας αλλά και από τον οργανισμό μας!

metraprofylaxis

Το παραπάνω άρθρο δημοσιεύτηκε από τη Νένα Δημητρίου στο ένθετο περιοδικό light&healthy (τεύχος #2, Νοέμβριος 2013, σελ. 46-47) της κυριακάτικης Καθημερινής.

Ετικέτες: , , , ,

Φίλησέ με… (πού;!)

peach

Ενδιαφέρον άρθρο σχετικά με τη βακτηριακή χλωρίδα του στόματος

αναρτήθηκε στον ακόλουθο σύνδεσμο —> http://health.in.gr/news/scienceprogress/article/?aid=1231270733

Τελικά, το ανθρώπινο στόμα αποδεικνύεται ένα σούπερ οικοσύστημα: σκεφτείτε ότι κάθε άνθρωπος

κατά μέσο όρο φιλοξενεί στη στοματική κοιλότητά του περί τους 150 διαφορετικούς μικροοργανισμούς!

navel

Υπερπλούσιος στο μικροβιακό φορτίο του έχει αποδειχτεί

και ο ανθρώπινος ομφαλός (όπου ανακαλύφτηκαν 1458 νέα βακτηριακά είδη!)

Διαβάστε και δείτε περισσότερα για το project “μικροβιακής ομφαλοσκόπησης”

σε αυτόν τον σύνδεσμο —> http://www.wildlifeofyourbody.org/

Και ποιος έχει σειρά; Μα φυσικά οι μασχάλες!

armpit2

Ας αναμένουμε τα επιστημονικά ευρήματα και από εκεί:  http://armpits.yourwildlife.org/

Ετικέτες: , ,

Αλλαγή μεγέθους γραμματοσειράς
Αντίθεση