Η Αμαλιάπολη ή αλλιώς Μιτζέλα έχει ξεχωριστή ιστορία, καθώς οι κάτοικοί της διακρίθηκαν για τον ηρωισμό τους στα χρόνια της ελληνικής επανάστασης του 1821, κυρίως με τις επιχειρήσεις στην ξηρά παρά με τις ενέργειές τους στη θάλασσα.
Δημιουργήθηκε το έτος 1834 από πρόσφυγες της Παλαιάς Μιτζέλας του Πηλίου αλλά και μερικούς άλλους από χωριά της Ανατολικής Θεσσαλίας που ήταν υπό Τουρκική σκλαβιά. Η παλαιά Μιτζέλα (βρισκόταν στο Βόρειο Πήλιο) καταστράφηκε ολοσχερώς από τους Τούρκους το καλοκαίρι του 1828 με αποτέλεσμα όσοι επέζησαν ή δεν αιχμαλωτίστηκαν να πάρουν τα γυναικόπαιδα τους και να καταφύγουν στη Σκόπελο. Το 1834 ύστερα από σκληρή προσπάθεια κατάφεραν να αγοράσουν τη δυτική παραλία του Παγασητικού που ονομαζόταν «Μονολιά» και με την κρατική συμπαράσταση να φτιάξουν νέο οικισμό, που ονομαζόταν «Νέα Μιτζέλα», αλλά το 1839 πήρε την ονομασία «Αμαλιάπολη» προς τιμή της πρώτης βασίλισσας της Ελλάδος Αμαλίας.
Στις 29 Νοεμβρίου 1840 ανακηρύχθηκε δήμος. Ιδρύθηκε Τελωνείο, Λιμεναρχείο, Στρατώνας για τη στρατιωτική φρουρά και αργότερα Δημοτικό Ταχυδρομείο. Το Δημοτικό σχολείο άρχισε να λειτουργεί το έτος 1837 . Αρχικά ήταν μικτό, ενώ το 1846 ιδρύθηκε το Δημοτικό Σχολείο Θηλέων.
Η πρώτη εκκλησία χτίστηκε το 1836 στο ίδιο ακριβώς σημείο που βρίσκεται και ο σημερινός ναός. Με το πέρασμα του καιρού κρίθηκε αναγκαίο ο μικρός ναός, που χτίστηκε το 1836, να αντικατασταθεί με έναν μεγαλύτερο ναό. Ο δεύτερος ναός θεμελιώθηκε το 1857 και ολοκληρώθηκε το 1872. Η κατασκευή του μαρμάρινου τέμπλου, καθώς και του μαρμάρινου άμβωνα της εκκλησίας, ανατέθηκε το έτος 1833 στον μαρμαρογλύπτη καλλιτέχνη Γεώργιο Λυρίτη, κάτοικο του χωριού Πάνορμος της Τήνου. Η επιλογή των Μιτζελιωτών στο πρόσωπό του ήταν απόλυτα επιτυχής. Πράγματι ο Τηνιακός μάστορας πραγματοποίησε άριστη εργασία και το μοναδικό μαρμάρινο τέμπλο στολίζει περίφημα τον ιστορικό ναό. Ο μεγαλοπρεπής ναός του χωριού είναι κοσμημένος με θαυμάσιες , μικρού και μεγάλου μεγέθους, εικόνες. Ξεχωρίζουν δύο απ΄ αυτές. Η εικόνα της Μεταμορφώσεως του Σωτήρος (σε θήκη με επίχρυσο πουκάμισο) και η Παναγία Ελεούσα., που είναι αφιέρωμα του μητροπολίτη Δημητριάδος Γερμανού Μαυρομάτη προς το ναό, ύστερα από παρέμβαση του Μιτζελιώτη αρχιδιακόνου Σωφρονίου Κ. Χρυσοχού το έτος 1920. Η εικόνα αυτή της Παναγίας που ιστορήθηκε από Ρώσους μοναχούς στη Ρωσία, φυγαδεύτηκε και έφτασε στην Ελλάδα για να διασωθεί μετά την επικράτηση της κομμουνιστικής επανάστασης το έτος 1917. Ο μητροπολίτης Γερμανός όρισε να γίνεται κάθε χρόνο λαμπρή πανήγυρη προς τιμήν της Θεοτόκου και των Αγίων Πάντων με εσπερινό, αρτοκλασία και θεία λειτουργία. Στην πορεία του χρόνου οι κάτοικοι της Νέας Μιτζέλας διακρινόμενοι για την ευσέβεια τους έχτισαν σε εξοχικές περιοχές και κοντά στη θάλασσα εξωκλήσια.
Σήμερα η Αμαλιάπολη αποτελεί δημοτικό διαμέρισμα του Δήμου Αλμυρού. Συνεχίζει την πορεία της ναυτικής παράδοσης και της ιστορίας της. Έχει αναπτυχθεί σε παραθεριστικό κέντρο που προσελκύει πολλούς ντόπιους και ξένους τουρίστες.
