ΚΟΡΩΝΟΙΟΣ:
ΜΗΠΩΣ ΠΕΡΑ ΑΠΟ ΤΗ ΓΕΝΕΤΙΚΗ ΣΥΣΤΑΣΗ ΤΟΥ ΑΝΘΡΩΠΟΥ ΓΙΑ ΤΗ ΒΑΡΥΤΗΤΑ ΤΩΝ ΚΛΙΝΙΚΩΝ ΣΥΜΠΤΩΜΑΤΩΝ ΕΧΕΙ ΣΗΜΑΣΙΑ ΚΑΙ Η ΓΕΝΕΤΙΚΗ ΣΥΣΤΑΣΗ ΤΟΥ ΚΟΡΩΝΟΙΟΥ, ΜΙΑ ΚΑΙ ΗΔΗ ΚΥΚΛΟΦΟΡΟΥΝ 3 ΠΑΡΑΛΛΑΓΕΣ ΤΟΥ;

H ανάλυση της γενετικής σύστασης του κορωνοϊού παρέχει τη δυνατότητα της ιχνηλάτησης της προέλευσης του ιού, σε πραγματικό χρόνο, σε όλον τον κόσμο. Διαπιστώθηκε η ύπαρξη ΤΡΙΩΝ παραλλαγών (A, B και C) του ιού. Η χρήση φυλογενετικών τεχνικών έδειξε ότι η πρωταρχική παραλλαγή που μόλυνε ανθρώπους στην πόλη Γουχάν είναι συγγενική και παρόμοια με εκείνη των νυχτερίδων και του παγκολίνου.
Η έρευνα αποκάλυψε τρεις διακριτές παραλλαγές (A, B, C) του COVID-19, που διακρίνονται μεταξύ τους από αλλαγές στα αμινοξέα τους και αποτελούνται από συστάδες στενά συγγενικών γενετικών γραμμών.
H παραλλαγή Α είναι η προγονική που μόλυνε τους ανθρώπους στην πόλη Γουχάν, αλλά δεν ήταν ο κυρίαρχος τύπος του ιού της πόλης. Η παραλλαγή Α συγγενεύει με τις παραλλαγές που βρίσκονται τόσο σε νυχτερίδες όσο και σε πανγκολίνους. Ο τύπος «Β» προέρχεται από τον «Α», και διαφέρει σε δύο μεταλλάξεις, στη συνέχεια προέκυψε η παραλλαγή «C».
Ο τύπος Β ήταν συχνότερος στη Γουχάν, και πιο διαδεδομένος σε ασθενείς σε όλη την Ανατολική Ασία.
Η παραλλαγή “C” είναι συχνότερη στην Ευρώπη, π.χ. σε ασθενείς από τη Γαλλία, την Ιταλία, τη Σουηδία και την Αγγλία.
Η νέα ανάλυση υποδηλώνει επίσης ότι μία από τις πρώτες εισαγωγές του ιού στην Ιταλία ήρθε μέσω της πρώτης τεκμηριωμένης λοίμωξης στις 27 Ιανουαρίου στη Γερμανία και ότι μια άλλη πρώιμη Ιταλική διαδρομή λοίμωξης αφορούσε άτομο που ταξίδεψε από τη Σιγκαπούρης.
Συμπερασματικά, το φυλογενετικό δίκτυο εντοπίζει πιστά τις οδούς μολύνσεων για τεκμηριωμένες περιπτώσεις νόσου του κορονοϊού 2019 (COVID-19), υποδεικνύοντας ότι τα φυλογενετικά δίκτυα μπορούν επίσης να χρησιμοποιηθούν με επιτυχία για την ανίχνευση μη καταγεγραμμένων πηγών μόλυνσης COVID-19, οι οποίες στη συνέχεια μπορούν να τεθούν σε καραντίνα για να αποφευχθεί η επαναλαμβανόμενη εξάπλωση της ασθένειας σε όλον τον κόσμο.
ΜΕΘΔΟΛΟΓΙΑ. Ερευνητές από το Ηνωμένο Βασίλειο και τη Γερμανία συγκέντρωσαν στοιχεία (24/12/2019 έως 4/3/2020) από 160 (σήμερα υπάρχουν διαθέσιμα 1000, τα οποία αναλύονται) γονιδιώματα ιού SARS-Cov-2, που είναι κατατεθειμένα σε ειδικές τράπεζες. ΄Ύστερα από κατάλληλη μαθηματική επεξεργασία σχεδίασαν το φυλογενετικό δένδρο των παραλλαγών του ιού. Τα φυλογενετικό δένδρο δείχνει σε πραγματικό χρόνο το πως ο ιός εξαπλώθηκε από την πόλη Γουχάν στην Ευρώπη. Οι τεχνικές αυτές χρησιμοποιούνται κυρίως στην Αρχαιογενετική για την ανίχνευση/χαρτογράφηση των κινήσεων των προϊστορικών ανθρώπινων πληθυσμών μέσω του DNA
*Βιβλιογραφία. Peter Forster, Lucy Forster, Colin Renfrew, and Michael Forster. Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes. PNAS first published April 8, 2020 https://doi.org/10.1073/pnas.2004999117