Οι στόχοι των προγραμμάτων συνεκπαίδευσης είναι η προώθηση της ένταξης και των ίσων ευκαιριών στην εκπαίδευση, καθώς και η ανάπτυξη των γνωστικών, μαθησιακών, ψυχο-συναισθηματικών και κοινωνικών δεξιοτήτων όλων των μαθητών και μαθητριών, συμπεριλαμβανομένων εκείνων με ειδικές εκπαιδευτικές ανάγκες. Παράλληλα, επιδιώκεται η ευαισθητοποίηση των μαθητών και μαθητριών της γενικής και ειδικής εκπαίδευσης σε θέματα ανθρωπίνων δικαιωμάτων, η καλλιέργεια του σεβασμού στη διαφορετικότητα και η ανάπτυξη δεξιοτήτων ενσυναίσθησης και για τα δύο σχολικά πλαίσια.

Τα προγράμματα συνεκπαίδευσης περιλαμβάνουν οργανωμένα παιχνίδια, αθλοπαιδίες, καλλιτεχνικές και άλλες δραστηριότητες που ενισχύουν την κοινωνική ανάπτυξη και την αποδοχή της διαφορετικότητας. Στο συγκεκριμένο πρόγραμμα οι μαθητές των δύο σχολείων αλληλεπίδρασαν σε κοινές δράσεις κατασκευής ενός δέντρου φιλίας με δραστηριότητες γραφής, έπαιξαν σε μουσικο-κινητικά παιχνίδια και αλληλεπίδρασαν σε παιχνίδια messy play.