Το 12^ο Γυμνάσιο Λάρισας λειτούργησε αυτόνομα το 1984 με διευθυντή τον κ. Κωνσταντίνο Τσιαμπέρα. Μέχρι τότε ήταν παράρτημα του 5^ου Γυμνάσιου Λάρισας.

Τη Διεύθυνση του σχολείου από την ίδρυση του έως σήμερα ανέλαβαν με την ακόλουθη σειρά:

• Κωσταντίνος Τσιαμπέρας (σχ. έτη 1984-1986)
• Δημοβέλης Γεώργιος (σχ. έτη 1986-1991)
• Κυρίτσης Κωνσταντίνος (σχ. έτη 1991-1992)
• Ντούλας Χαρίλαος (σχ. έτη 1992-1997)

Το διδακτήριο κατασκευάστηκε το έτος 1995-1997 σε οικόπεδο που αγοράστηκε από την Νομαρχία Λάρισας μετά από ενέργειες του Διευθυντή Χαριλάου Ντούλα και του συλλόγου γονέων και κηδεμόνων του σχολείου.

Το 12^ο Γυμνάσιο μεταστεγάστηκε στο νέο κτήριο τον Σεπτέμβριο του 1997 επί του αναπληρωτή διευθυντή Αθ. Δουμακή.

• Ακολούθησαν οι παρακάτω διευθυντές:
• Δουμακής Αθανάσιος (από 1-9-1997 έως 16-10-97 αναπληρωτής διευθυντής)
• Ζιάκος Γεώργιος (σχ. έτη 1997-2006)
• Μπαρμπούτης Στυλιανός (σχ. έτη 2006-2011)
• Ντελής Χρήστος (σχ. έτη 2011-2018)
• Διβάνη Ελένη (σχ. έτη 2018-2022)
• Μίζιος Αθανάσιος – αναπληρωτής Διευθυντής (Απρίλιος 2022 – Ιούνιος 2023)