- Τμήμα Μηχανικών Οικονομίας και Διοίκησης (Χίος)
- Τμήμα Μηχανικών Πληροφοριακών και Επικοινωνιακών Συστημάτων (Σάμος)
- Τμήμα Μηχανικών Σχεδίασης Προϊόντων και Συστημάτων (Σύρος)
Σχολή Κοινωνικών Επιστημών (με έδρα τη Μυτιλήνη)
- Τμήμα Κοινωνικής Ανθρωπολογίας και Ιστορίας
- Τμήμα Γεωγραφίας
- Τμήμα Κοινωνιολογίας
- Τμήμα Πολιτισμικής Τεχνολογίας και Επικοινωνίας
- Τμήμα Περιβάλλοντος (Μυτιλήνη)
- Τμήμα Ωκεανογραφίας και Θαλασσίων Βιοεπιστημών (Μυτιλήνη)
- Τμήμα Επιστήμης Τροφίμων και Διατροφής (Λήμνος)
Σχολή Επιστημών της Διοίκησης (με έδρα τη Χίο)
- Τμήμα Διοίκησης Επιχειρήσεων
- Τμήμα Ναυτιλίας και Επιχειρηματικών Υπηρεσιών
- Τμήμα Οικονομικής και Διοίκησης Τουρισμού
Σχολή Θετικών Επιστημών (με έδρα τη Σάμο – Καρλόβασι)
