Το Γυμνάσιο Καρυών ιδρύθηκε το σχολικό έτος 1989-1990.Έως τότε λειτουργούσε ως παράρτημα του Γυμνασίου Περάματος. Η μετονομασία από «Γυμνάσιο Καρυών» σε «Γυμνάσιο Μεταμόρφωσης» ισχύει από το σχολικό έτος 2001-2002.
Κατά τα πρώτα χρόνια της λειτουργίας του στεγάστηκε στο κτίριο του Δημοτικού Σχολείου Μεταμόρφωσης. Από το σχολικό έτος 1996-1997 στεγάζεται στο κτίριο που ανεγέρθηκε στο βορειοδυτικό τμήμα του οικισμού, για το σκοπό αυτό.
Οι μαθητές και οι μαθήτριες του σχολείου μας προέρχονται τόσο από τη Μεταμόρφωση όσο και από τα χωριά της γύρω περιοχής.