Το 6ο Δημοτικό Σχολείο Ρεθύμνου βρίσκεται στην περιοχή της Καλλιθέας, στη γωνία των οδών Θεοτοκοπούλου και Κολοκοτρώνη. Είναι 12/θ αλλά λειτουργούσε τα προηγούμενα χρόνια με 18 τμήματα λόγω της πληθώρας των μαθητών. Με τη μεταφορά του 14ου Δημοτικού στο νέο κτίριο, την αλλαγή των ορίων και τις μετεγγραφές πολλών μαθητών σε αυτό, ελαττώθηκε ο αριθμός των μαθητών και πλέον λειτουργούμε με 16 τμήματα. 

Οι μαθητές στεγάζονται στο τριώροφο κτήριο στο οποίο υπάρχουν δύο αυλές όπου γίνεται το διάλειμμά τους.

• Στο κάτω επίπεδο υπάρχουν 5 αίθουσες όπου στεγάζονται τα  τμήματα της Α΄ και της Β΄τάξης.
• Στο μεσαίο επίπεδο υπάρχουν 9 αίθουσες όπου στεγάζονται τα τμήματα της Γ΄ τάξης, της Δ΄, η αίθουσα Πληροφορικής, η αίθουσα Μουσικής, η αίθουσα Φυσικής Αγωγής, όπου γίνεται η εκμάθηση χορού και το ένα από τα δύο τμήματα ένταξης.                                                                          
• Στο πάνω επίπεδο υπάρχουν 6 αίθουσες όπου στεγάζονται τα τμήματα της Ε’ και ΣΤ΄ τάξης, καθώς και το δεύτερο τμήμα ένταξης.

Το σχολείο λειτουργεί με έξι τμήματα Ολοημέρου με την κα. Δολιανίτου Μαργαρίτα ως Υπεύθυνη.