Στο 5ο Πειραματικό Γυμνάσιο Κομοτηνής, τη φετική χρονιά θα λειτουργήσουν, σύμφωνα με τις σχετικές διατάξεις λειτουργίας των Πειραματικών σχολείων και σύμφωνα με την απόφαση της Επιστημονικής Επιτροπής Προτύπων και Πειραματικών σχολείων (αρ.πρωτ. 114407/Δ6/12-10-2013 και 69/Δ.Ε.Π.Π.Σ./05-10-2023) Όμιλοι Δημιουργικότητας και Καινοτομίας, τμήματα Ενισχυτικής Διδασκαλίας καθώς και Καινοτόμες Δράσεις.