Δύο φορές το μήνα ο Ναυτικός Τομέας και οι Πλοίαρχοι του ΕΠΑ.Λ. Κονιστρών επισκέπτονται και χρησιμοποιούν τα εργαστήρια της Ακαδημίας Εμπορικού Ναυτικού Κύμης και κυρίως τους μεγάλους προσομοιωτές γέφυρας και τα ραντάρ των ηλεκτρονικών ναυτικών χαρτών.
Το πρόγραμμα σπουδών, τα εργαστήρια των πλοιάρχων και των μηχανικών και τα βιβλία τα οποία διδάσκονται οι σπουδαστές μας είναι τα ίδια με τις Ακαδημίες Εμπορικού Ναυτικού της χώρας, καθώς και με οποιοσδήποτε άλλη Σχολή Εμπορικού Ναυτικού στην Ευρώπη, η οποία δίνει πτυχία Πλοιάρχου και Μηχανικού.
